Доктор исторических наук, профессор, ведущий научный сотрудник Отдела истории славянских народов Юго-Восточной Европы в Новое время.
Греческая революция 1821 года в представлениях ее участников: к исследованию национального самосознания // Вестник Московского Университета. Сер. 8. История. 1997, № 2. С. 27-44.
“Русская партия” и развитие национальной идеологии в Греции (Пророчества о восстановлении Византийской империи в 1840 году) // Вестник Московского Университета. сер. 8. История. 1997, № 6. С. 76-88.
Афонский вопрос в 1912-1917 гг. по материалам русских дипломатических источников // Вестник архивиста. 2002, № 1. С. 64-82.
Православная церковь в формировании концепции нации и подготовке освобождения греков от османского ига (XVII-XIX века) // Религии мира: история и современность. 2003. М., 2003. С. 135-153.
Для чего переписывают историю (об историческом образовании в Греции) // Высшее образование в России. 2003. № 6. С. 137-142.
«Великая идея» и геополитическая ситуация на Балканах на рубеже XX-XXI веков // Полития. Лето 2003. № 2. С. 91-113.
Православие и неоязычество в современной Греции // Религии мира: история и современность. 2005. М., 2007. С. 293-298.
Греческие печати на документах эпохи революции 1821 г. как исторический источник // Информационный бюллетень ГУ «Московский дом национальностей». 2007, № 8. С. 85-105.
50 лет на службе России: портрет российского дипломата XIX в. И. Э. Персиани // Вестник Московского университета. Сер. 21. Управление (государство и общество). 2008. № 1. С. 84-96.
Представления греков о судьбе Османской империи в XVIII - начале ХХ в. // Вестник Московского университета. Сер. 13. Востоковедение. 2009. № 1. С. 44-54.
Η «Συνωμοσία των Φιλορθοδόξων» (1839-1840) και η ρωσική διπλωματία // Ρωσία και Μεσόγειος. Πρακτικά Α΄ Διεθνούς Συνεδρίου (Αθήνα, 19-22 Μαϊου 2005). Τ. Β΄. Αθήνα, 2011. Σ. 299-306.
«Великая идея» в греческой литературе и искусстве XIX – начала ХХ века // Новая и новейшая история. 2012, № 6. С. 179-188.
Интеграция Афона в состав греческого государства в первой четверти ХХ в. // Вестник Московского университета. Сер. 21. Управление (государство и общество). 2014, № 2. С. 107-125.
Митрополит Нил Пентапольский и его роль в греко-российских церковных отношениях второй половины XIX в. // Вестник Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Сер. II. История. История Русской Православной Церкви. 2017. Вып. 79. С. 30-45.
Политическая система современной Греции. М., 1999.
Греческая нация и государство в XVIII-XX в.: Очерки политического развития. М., 2010.
Дневники путешествия по России греческих монахов афонского монастыря Симонопетра 1888-1892. М.: Индрик, 2014. 96 с. 6 п. л. Подготовка издания Л. А. Герд и О. Е. Петруниной.
Персиани И. Э. Рассуждения о Греции. От прибытия короля до конца 1834 года / Перевод с французского, вступительная статья и комментарии О. Е. Петруниной. М.: «Индрик», 2016.
Румыния и Египет в 1860-1870-е гг. Письма российского дипломата И. М. Лекса к Н. П. Игнатьеву / Подготовка текста, вступительная статья и комментарии О. Е. Петруниной. М.: «Индрик», 2016.
См. также полный список работ на сайте МГУ и основные работы на сайте Academia.edu.